分析方法 · 基础教学
乙酰化、酰胺化改了哪里？看懂肽两端的修饰
先认识肽的两端，再把乙酰化、酰胺化和乙酸盐分清楚。
两份标签上的氨基酸顺序相同，一份却多了“Ac”或“amide”。它们还是同一种材料吗？这些小标记可能说明肽的两端做了修饰。顺序一样，并不表示两端也一样。我们先看修饰在哪里，再算质量怎样变化。
先找到肽的起点和终点
肽序列通常从氨基端写向羧基端，分别叫 N 端和 C 端。可以把它们理解为链的起点和终点。改了端部的基团，序列字母可能没变，分子却已经不同。
图中画的是简化的端基变化，用来帮助理解位置，不是分子的三维结构。
N 端乙酰化，会增加多少质量？
与相应未修饰端相比，乙酰化净增加的组成是 C2H2O，单同位素质量增加 42.010565 Da。
除了写“乙酰化”，还要写位置。仅看到质量增加约 42，不能确定乙酰基一定在 N 端，也可能需要排查其它可修饰位置。
C 端酰胺化，为什么质量反而略小？
简化来看，C 端的 COOH 变成 CONH2。这是替换了一部分原子，并不是简单再挂上一个额外基团。按单同位素质量计算，变化为 −0.984016 Da。
负号别漏掉：它是减去接近 1 Da，不是增加。如果产品资料用的是平均质量，就应按对应方式计算，不能混用。
两端都修饰，怎么一起算？
假设未修饰分子的单同位素质量为 1,000.000000 Da，其它部分不变。做 N 端乙酰化，加 42.010565；做 C 端酰胺化，减 0.984016。两项一起算，得到 1,041.026549 Da。
这一步是在算质量差，不是在预测修饰后功效或稳定性会怎样变化。
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1,000.000000 − 0.984016 = 999.015984 Da。
“乙酰化”和“乙酸盐”，不要混为一谈
乙酰化，是乙酰基通过化学键连到了分子上。乙酸盐说的是材料相关的盐成分或反离子。标签写“乙酸盐”，不能据此认定肽做过 N 端乙酰化。
填写规格时，把序列、N 端、C 端、其它修饰和盐形式分别写清楚，不要用一个词代替它们。
查看 Thymosin α1、KPV 变体时，别漏掉两端
查看 Thymosin α1 或 KPV 的具体变体时，不只看产品名，还要找两端基团的写法。询价或比较材料时，把端基与序列一起提供，可以避免选到看起来同名、实际不同的形式。