乱序肽把氨基酸顺序打乱，同时保留原来的氨基酸组成。研究人员可以借它判断观察到的现象是否与原始顺序有关。“乱序”说明设计方式，不保证新序列没有作用。
用四个氨基酸看懂乱序
看一个虚构例子：原序列为R-K-L-W，对照序列为W-L-R-K。两者都各含一个精氨酸、赖氨酸、亮氨酸和色氨酸，四种成分相同，顺序不同。JPT对乱序肽库的介绍采用了这种保留组成的设计思路。[1]
顺序不同，完整分子的质量仍可能相同
如果两条链的末端和其他修饰也相同，把这些氨基酸重新排序不会改变元素组成和预期完整分子质量。仅凭质量匹配，不能区分这两个序列。因此，订单要写出完整对照序列，不能只写“质量相同，打乱顺序”。
对照是否合适，需要在实验中验证
重新排列的肽仍可能与实验系统发生相互作用，处理表现也可能不同。应把它作为候选对照，验证是否合适。根据研究问题，可能还需要仅含溶剂的对照、无关序列或多个乱序版本。设计出一条序列，不等于完成了对照验证。
尽量让比较只围绕一个问题
如果想研究顺序的影响，尽量不要同时更换标签、末端、盐形式或要求的纯度。无法避免的差异要记录下来，否则实验结果不同可能有多种解释。
把原序列和对照序列一起提交
为每条序列设置编号，列出残基顺序、相关位置的D/L构型、末端、修饰、数量和需要的检测。合成前，请供应商确认组成比较和能够提供的身份依据。可以将两条序列一起提交NHD询价表，进行项目评估。
相关资料与咨询
仅供实验室研究、开发和制造使用，不适用于人类或兽医用途。
资料来源与算例说明
参考资料用于解释主题，不证明NHD库存、供应批次的结果或临床适用性。明确标注为假设的例子是计算演示，不是检测数据。
