スクランブルペプチドは、アミノ酸組成を保ちながら配列を並べ替えたものです。研究者は、観察した作用が元の順序に依存するかを調べるために使う場合があります。「スクランブル」は材料の設計方法を表す語であり、新しい配列に作用がないことを保証しません。
4残基の例
架空の配列R-K-L-Wと、対照候補W-L-R-Kを考えます。どちらもアルギニン、リジン、ロイシン、トリプトファンを1つずつ含みます。4つの構成要素は同じですが、順序が異なります。JPTは、このように組成を維持する方法でスクランブルライブラリーを説明しています。[1]
順序が異なっても質量は一致しうる
両鎖の末端基とその他の修飾も同じなら、同じ残基を並べ替えても元素組成と予想される分子全体の質量は維持されます。質量の一致だけでは、この2つの配列を区別できません。そのため注文には、「同質量のスクランブル」だけでなく、対照の完全な配列が必要です。
対照が不活性だと決め付けない
並べ替えた鎖でも、アッセイと相互作用する場合があります。実務的な取り扱いも異なりえます。対照候補として扱い、適合性を試験してください。研究上の問いによっては、溶媒だけの条件、無関係な配列、複数のスクランブル配列が必要です。配列設計は、これらの確認の代わりにはなりません。
比較を理解しやすくする
配列順序の研究が目的なら、標識、末端基、塩形、依頼純度を同時に説明なく変えることは避けてください。避けられない違いは記録しましょう。そうしなければ、実験の差に複数の説明が生じます。
両配列を1つの明確な表にする
各配列に識別子を付けてください。残基の順序、必要に応じたD/L立体配置、末端基、修飾、数量、必要な確認を含めます。合成前に、組成比較と提供可能な同一性の証拠を供給元に確認してもらいましょう。NHDの見積もりフォームから、この組をプロジェクト評価用に送れます。
関連リンク
実験室での研究、開発および製造専用です。ヒトまたは動物への使用を目的としたものではありません。
出典と例
参考資料は本テーマを説明するものであり、NHDの在庫、供給ロットの試験結果、または臨床用途への適合性を証明するものではありません。仮定の例と明記されたものは計算例であり、試験データではありません。
