截短文库是同一肽段的一组较短版本。不是改变某个氨基酸,而是从一端移除残基。这样研究就能将原始链与更短的链进行比较。在请求报价之前,先决定要缩短哪一端,以及文库应短到什么程度。
截短不同于重叠扫描或丙氨酸扫描
重叠肽库,是沿着较长序列依次选取固定长度的片段;丙氨酸扫描,是把指定位置的氨基酸换成丙氨酸;截短肽库,则通过去掉末端的氨基酸来改变肽链长度。JPT 将它们列为不同的肽库设计。它们研究的问题不同,订购时应说明采用哪种设计,并附上实际序列清单。
一个10个残基的肽段在单端系列中可产生六个序列
想象教学序列ACDEFGHIKL,从N端到C端书写。保持其C端固定,仅从N端一次缩短一个残基。如果最短链为五个残基,你的列表是ACDEFGHIKL、CDEFGHIKL、DEFGHIKL、EFGHIKL、FGHIKL和GHIKL。
这样一共有六条序列,包含原始序列:10 − 5 + 1 = 6。这是为了说明规划方法而设定的例子,并非经过验证的实验方案,也不是 NHD 产品规格。
在此示例中,测试两端会得到11个独特序列
再单独增加一组保持 N 端不变、从 C 端逐步截短的序列:ACDEFGHIKL、ACDEFGHIK、ACDEFGHI、ACDEFGH、ACDEFG 和 ACDEF。两组各有六条,但原始序列重复出现。去掉重复项后,共有 6 + 6 − 1 = 11 条不同序列。
这里统计的是两组分别从一端截短的序列,并不包含同时从两端截短得到的所有片段。设计方式、最短长度或每次截短的步长不同,数量也会变化。订购时请附上最终序列清单,不要只写“双端截短肽库”。
保持比较清晰
为每个序列标明末端基团,包括任何乙酰化或酰胺化。去除残基会改变分子量,因此相同的毫克数并不等于相同的摩尔量。如果你的比较需要等摩尔量,请说明,并询问这些量将如何确定。我们的 等质量与等摩尔指南 详细讨论了这个问题。
向 NHD 发送序列电子表格、最小长度、每个序列的数量和所需文件。使用 定制合成咨询 来讨论可行性。该示例仅说明规划,不保证文库生产、活性或交付时间。
仅供实验室研究使用。不得用于人体或兽医用途。
参考文献
如何阅读本文
示例为计算,不是 NHD 批次结果。请确认项目可行性和文档可用性。
研究用途说明: 本站所述目录材料仅供实验室研究、开发和制造使用,不适用于人类或兽医用途。本文不构成医疗建议,也不提供使用或给药说明。
原始记录与权威资料
- JPT:多肽混合与文库服务技术参考;数值规划示例为原创计算。




