ANALYTISCHE METHODEN · PRAXISLEITFADEN
MOTS-c und ein +16 Da Signal: Einen Oxidationskandidaten durcharbeiten
Finde die zwei Methionine von MOTS-c und verfolge dann die Massenänderung durch ein hinzugefügtes Sauerstoffatom.
Ein MOTS-c-Signal erscheint etwa 16 Da schwerer als erwartet. Oxidation ist eine mögliche Ursache, die untersucht werden sollte. Um diesen Hinweis zu verstehen, müssen wir jedoch zuerst die relevanten Aminosäuren finden und prüfen, ob der Plot die Molekülmasse oder m/z zeigt.
Finden Sie die zwei M-Buchstaben
Eine gängige MOTS-c-Referenzsequenz ist MRWQEMGYIFYPRKLR. M steht für Methionin. Zählen Sie von Anfang an: Die beiden M-Reste befinden sich an den Positionen 1 und 6.
Verwenden Sie bei der Bewertung einer Probe die tatsächlich angegebene Sequenz und die Endgruppen. Die Referenzsequenz ist ein Ausgangspunkt, kein Ersatz für die Spezifikation des Materials.
Warum ein Sauerstoffatom etwa 16 Da ergibt
Das Hinzufügen eines Sauerstoffatoms ergibt eine Zunahme der monoisotopischen Masse um 15.994915 Da im Unimod-Oxidationsdatensatz. Bei zwei Sauerstoffatomen beträgt die Zunahme 31.989830 Da. In der Diskussion werden diese oft zu +16 und +32 verkürzt.
Diese gerundeten Zahlen sind nützliche Hinweise. Ein genauer Vergleich verwendet den präziseren Wert und die korrekte molekulare Form.
Warum sich das Spektrum möglicherweise nur um 8 verschiebt
Bei passenden doppelt geladenen Ionen teilen Sie die Massenänderung durch zwei. Ein Sauerstoff verschiebt dann m/z um etwa 7.99746. Zwei Sauerstoffatome verschieben es um etwa 15.99492.
Daher ist “eine Verschiebung von 16” unklar, ohne anzugeben, welche Achse und Ladung gemeint ist.
Kann die Gesamtmasse sagen, welches M sich geändert hat?
Nicht für sich allein. Eine Oxidation an entweder Methionin kann die gleiche Zunahme um einen Sauerstoff in der Gesamtmasse ergeben. Geeignete Fragmentdaten und ein chromatographischer Vergleich können helfen, den Ort und Alternativen zu untersuchen.
Das Spektrum kann auch nicht sagen, wann die Änderung erfolgte. Bewahren Sie Lagerungs- und Handhabungsaufzeichnungen zusammen mit den analytischen Daten auf.
Versuchen Sie ein Signal mit drei Ladungen
Rechnen Sie die Peakintensität nicht direkt in einen Gewichtsprozentsatz der Oxidation um. Dafür ist eine geeignete quantitative Methode erforderlich.
Antwort ansehen
15.994915 ÷ 3 ≈ 5.33164. Dieser Wert allein verrät noch nicht, wo die Veränderung liegt.
Was Sie bei einer MOTS-c-Probe fragen sollten
Bestätigen Sie bei MOTS-c die tatsächliche Sequenz und die Endgruppen, und fragen Sie, welche Informationen zur Identität oder Stabilität verfügbar sind. Diese Lektion erklärt eine mögliche Massenänderung; sie nennt kein Oxidationsniveau einer Charge und keine Haltbarkeit.
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