Votre document sur le peptide indique une masse moléculaire proche de 2,000 Da, mais le spectre présente un pic proche de 1,001. Le fournisseur a-t-il envoyé le mauvais matériel ? Ce nombre seul ne permet pas de répondre à la question. Un spectromètre de masse mesure la masse divisée par la charge, généralement notée m/z.
Une molécule peut porter plus d'une charge
Considérez le nombre de l’instrument comme une valeur divisée. En électrospray positif, un peptide peut capter plus d’un proton. Deux charges divisent la masse de l’ion par deux ; trois la divisent par trois. L’introduction de Thermo Fisher explique pourquoi la spectrométrie de masse rapporte des valeurs masse-sur-charge plutôt qu’un simple poids.
Un exemple concret : 2,000 Da devient environ 1,001 m/z
Prenons un peptide imaginaire de masse neutre 2,000 Da. Pour les ions positifs avec protons uniquement, utilisez m/z = (M + z × 1.0073) ÷ z, où M est la masse neutre et z la charge. La masse approximative du proton est 1.0073 Da. À la charge +1, le résultat est 2,001.0073 ; à +2, il est 1,001.0073 ; à +3, il est 667.6739.
Ce sont des valeurs pédagogiques calculées, et non des résultats de test NHD. Elles décrivent trois états de charge de la même molécule hypothétique. Le nombre plus petit ne signifie pas que la chaîne peptidique s'est cassée en deux.
Demandez quel nombre le rapport affiche
Vérifiez l'attribution des charges et si le rapport fournit des m/z brutes ou une masse neutre reconstruite. Demandez aussi s'il utilise la masse monoisotopique ou la masse moyenne. Ce sont différentes façons de résumer les isotopes. Les adduits de sodium, d'autres formes ioniques et les fragments nécessitent une interprétation différente ; la simple formule avec protons seuls ne les couvre pas.
Une concordance de masse est utile, mais ce n'est pas l'intégralité du contrôle qualité
Une masse concordante soutient l'identité proposée. Elle ne prouve pas, à elle seule, l'ordre de la séquence, la pureté ou la quantité de peptide dans la poudre. Utilisez le résultat de masse avec les enregistrements analytiques convenus. Notre Guide d'identification par LC-MS explique cette distinction.
Acheter un matériel de catalogue tel que LL-37, ou demander une séquence personnalisée ? Envoyez à NHD le matériel exact et demandez quels enregistrements d'identité sont disponibles. Confirmez la portée avant de commander ; cet exemple n’établit l’identité d’aucun lot fourni.
Pour la recherche en laboratoire uniquement. Non destiné à un usage humain ou vétérinaire.
Références
- Thermo Fisher : Aperçu de la spectrométrie de masse
- Thermo Fisher : Attribution des charges des données de masse à résolution isotopique
Sources et méthode éditoriale
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Comment interpréter cet article
Les exemples sont des calculs, pas des résultats de lot NHD. Confirmez la faisabilité du projet et la disponibilité des documents.
Limite de l’usage de recherche : Les matériaux du catalogue évoqués sur ce site sont uniquement destinés à la recherche en laboratoire, au développement et à la fabrication, pas à un usage humain ou vétérinaire. Ce contenu n’est pas un conseil médical et ne fournit pas d’instructions d’administration.
Documents primaires et sources faisant autorité
- Thermo Fisher : Aperçu de la spectrométrie de masseRéférence technique ; les exemples de planification numérique sont des calculs originaux.
- Thermo Fisher : Attribution des charges des données de masse à résolution isotopiqueRéférence technique ; les exemples de planification numérique sont des calculs originaux.
