あなたのペプチド文書には 2,000 Da 付近の分子量が記載されていますが、スペクトルには 1,001 付近にピークがあります。供給元は間違った物質を送ったのでしょうか。その数値だけでは答えられません。質量分析計は質量を電荷で割った値を測定し、通常 m/z と表記します。
1つの分子が複数の電荷を帯びることがあります
装置が示す数値は割り算された値だと考えてください。ポジティブエレクトロスプレーでは、ペプチドは複数のプロトンを取り込むことがあります。電荷が2つならイオンの質量は2で割られ、3つなら3で割られます。Thermo Fisher の入門記事は、質量分析が単純な重量ではなく質量対電荷の値を報告する理由を説明しています。
計算例：2,000 Da は約 1,001 m/z になります
中性質量 2,000 Da の仮想ペプチドを考えます。プロトンのみのポジティブイオンでは、m/z = (M + z × 1.0073) ÷ z を使います。ここで M は中性質量、z は電荷です。プロトン質量の概算値は 1.0073 Da です。電荷 +1 では 2,001.0073、+2 では 1,001.0073、+3 では 667.6739 となります。
これらは計算による教育用の値であり、NHD の試験結果ではありません。同じ仮想分子の3つの電荷状態を表しています。小さい数値はペプチド鎖が半分に切れたことを意味しません。
報告書がどの数値を示しているか確認してください
電荷の割り当てを確認し、報告が生のm/zを示しているのか、再構成された中性質量を示しているのかを確かめてください。また、単同位体質量と平均質量のどちらを使っているかも尋ねてください。これらは同位体を要約する異なる方法です。ナトリウム付加体、他のイオン形態、フラグメントは異なる解釈が必要で、単純なプロトンのみの式では対応できません。
質量の一致は有用ですが、それだけが品質チェックのすべてではありません
質量の一致は提案された同一性を支持します。しかしそれ自体で、配列順序、純度、粉末中のペプチド量を証明するものではありません。質量の結果は、合意された分析記録と併せて使用してください。私たちの LC–MSによる同定ガイド がその区別を説明しています。
カタログ品目を購入しますか、例えば LL-37、それともカスタム配列を依頼しますか？ NHD に正確な物質を送り、どの同一性記録が利用可能かを尋ねてください。注文前に範囲を確認してください。この例は、供給されたロットの同一性を確立するものではありません。
実験研究専用。人または動物への使用はできません。
参考文献
この記事の解釈方法
例は計算であり、NHDロットの結果ではありません。プロジェクトの実現可能性と文書の入手可否を確認してください。
研究用途の境界： このウェブサイトで取り上げるカタログ材料は、実験室の研究、開発、製造専用であり、ヒトまたは動物への使用を目的としません。本内容は医療助言ではなく、投与指示を提供しません。
一次記録と権威ある出典
- Thermo Fisher: 質量分析の概要技術参考資料。数値計画の例は独自の計算です。
- Thermo Fisher: 同位体分離された質量データの電荷の割り当て技術参考資料。数値計画の例は独自の計算です。
