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肽修饰质量计算器
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计算依据
方法和源记录
这些链接记录了计算约定或实验室背景。他们不会验证目录批次或取代受控实验室方法。
- 01技术来源
PeptideMass 翻译后修饰语法
SIB ExPASy。用于表达离散肽修饰以及单字母序列的文档。
- 02技术来源
肽质量计算文档
SIB ExPASy。技术说明涵盖平均和单一同位素质量以及组合修饰预测的限制。
- 03技术来源
Unimod 35:氧化
元素增量O;单同位素变化 +15.994915 Da。选定的蛋氨酸氧化是一种理论上的修饰,而不是它发生的证据。
- 04技术来源
Unimod 1:乙酰基
元素增量C2H2O;单同位素变化 +42.010565 Da。该工具中的基础质量包括所选的终端基团。
- 05技术来源
Unimod 21:磷酸化
HPO3;+79.966331 Da。本工具仅支持 S/T/Y,这是从来源记录中有意选取的子集。来源映射已于 2026-09-10 核对。
- 06技术来源
Unimod 2020:二硫化物
H(-2); -2.015650 Da 每个肽内半胱氨酸对。每个半胱氨酸可以仅分配给一对。源映射已检查 2026-09-10。
- 07技术来源
Unimod 3:生物素
C10H14N2O2S; +226.077598 达。支持赖氨酸或游离 N 末端,无需额外的连接体质量。源映射已检查 2026-09-10。
- 08技术来源
Unimod 47:棕榈酰
C16H30O; +238.229666 达。简化的兼容位点模型:C/K/S/T 或明确选择的游离 N 末端;不是反应预测。源映射已检查 2026-09-10。
- 09技术来源
Unimod 2:酰胺化
H N O(-1);−0.984016 Da。选择 C 端酰胺化时,该修饰已计入基础分子式。来源映射已于 2026-09-10 核对。
- 10技术来源
Unimod 28:N 端 Gln → 焦谷氨酸
NH3 损失; −17.026549 Da。需要 N 末端 Q 并排除同时的 N-乙酰化。源映射已检查 2026-09-10。
- 11技术来源
Unimod 27:N 端 Glu → 焦谷氨酸
H2O 损失; −18.010565 Da。需要 N 末端 E 并排除同时的 N-乙酰化。源映射已检查 2026-09-10。
- 12技术来源
Thermo Fisher:FITC 试剂成分
C21H11NO5S;计算出添加 FITC 试剂的单同位素增量 +389.035794 Da。该链接的试剂记录不描述所提供的肽批次。源映射已检查 2026-09-10。
- 13技术来源
Thermo Fisher:胺反应性 FITC
支持的标记模型使用赖氨酸侧链或游离 N 端胺。其他衍生物和间隔物需要它们自己的元素增量。源映射已检查 2026-09-10。
- 14技术来源
Sigma-Aldrich:聚乙二醇
仅重复算术使用 C2H4O,+44.026215 Da 每个单元。它不包括端基、共轭损失和接头;它不是完整的 PEG 试剂的质量。源映射已检查 2026-09-10。
