MÉTHODES ANALYTIQUES · GUIDE PRATIQUE
Pourquoi les pics d'un spectre de masse forment un amas : espacement isotopique et charge
Lisez les écarts dans un groupe de pics isotopiques pour comprendre la charge.
Plusieurs pics rapprochés apparaissent dans le spectre. S'agit-il de plusieurs impuretés ? Il peut plutôt s'agir d'un groupe isotopique provenant d'un seul type de molécule. L'écartement peut aider à expliquer la charge de l'ion.
Un même élément peut avoir des masses légèrement différentes
Les atomes d'un même élément peuvent avoir des nombres de neutrons différents. Ces versions sont appelées isotopes. Une molécule contenant un isotope plus lourd a une masse légèrement différente, même lorsque sa séquence peptidique n'a pas changé.
Les peptides contiennent de nombreux atomes, de sorte qu'un échantillon peut donner un groupe de signaux isotopiques proches plutôt qu'une seule raie. Les motifs réels dépendent des éléments et des combinaisons isotopiques présentes.

Pourquoi une charge plus élevée resserre les écarts
L'axe est m/z : masse de l'ion divisée par la charge. En utilisant une approximation courante de l'écart isotopique du carbone de 1.00335 Da, un groupe à charge unique présente des écarts proches de 1.00335 m/z. Avec deux charges, les écarts sont proches de 0.50168 ; avec trois, proches de 0.33445.
La différence de masse est divisée par un nombre plus grand. C'est pourquoi les pics se rapprochent sur cet axe.

Lisez l'échelle, pas seulement la forme
Zoomez sur un amas clairement résolu et soustrayez les positions des pics adjacents. Un écart proche de 0.50 m/z suggère deux charges dans ce modèle. Un écart proche de 0.33 suggère trois charges.
Cela ne fonctionne que si vous comparez des pics du même amas. Des amas qui se chevauchent ou une résolution insuffisante peuvent rendre l'estimation trompeuse.
Reconvertir le m/z en masse moléculaire
Supposons que l'ion soit confirmé comme [M+2H]2+ et que son m/z soit 501.0073. Multipliez par deux, puis soustrayez la masse des deux protons ajoutés : 2 × 501.0073 − 2 × 1.007276 ≈ 1,000.0000 Da.
L'écart aide à estimer la charge, mais n'établit pas à lui seul le type d'adduit. Vérifiez la formule de l'ion avant d'utiliser ce calcul.

Essayez de lire un amas à trois charges
Un amas convaincant peut aider à interpréter le signal de masse. Il ne mesure pas l'activité du peptide et n'établit pas chaque position de sa séquence.
Voir la réponse
Trois charges, à condition que les pics appartiennent à un amas suffisamment résolu.
Vérification des tracés MOTS-c et SS-31
Pour les spectres MOTS-c ou SS-31, demandez quels amas isotopiques et états de charge soutiennent la masse moléculaire rapportée. Conservez le spectre annoté avec le calcul.
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MOTS-c (Human)
LL-37