ANALYTISCHE METHODEN · PRAXISLEITFADEN
Warum Massenspektrum-Peaks einen Cluster bilden: Isotopenabstand und Ladung
Lesen Sie die Abstände in einer Gruppe von Isotopenpeaks, um die Ladung zu verstehen.
Im Spektrum erscheinen mehrere dicht beieinanderliegende Peaks. Handelt es sich um mehrere Verunreinigungen? Möglicherweise sind es stattdessen ein Isotopencluster einer Molekülart. Der Abstand kann helfen, die Ladung des Ions zu erklären.
Dasselbe Element kann leicht unterschiedliche Massen haben
Atome desselben Elements können unterschiedlich viele Neutronen haben. Diese Varianten nennt man Isotope. Ein Molekül mit einem schwereren Isotop hat eine etwas andere Masse, selbst wenn sich seine Peptidsequenz nicht geändert hat.
Peptide enthalten viele Atome, daher kann eine Probe eine Gruppe benachbarter Isotopensignale statt einer einzelnen Linie ergeben. Die tatsächlichen Muster hängen von den vorhandenen Elementen und Isotopenkombinationen ab.

Warum mehr Ladung die Abstände verringert
Die Achse ist m/z: Ionenmasse geteilt durch Ladung. Mit einer üblichen Näherung für den Kohlenstoff-Isotopenabstand von 1.00335 Da hat eine Gruppe mit einfacher Ladung Abstände nahe 1.00335 m/z. Bei zwei Ladungen liegen die Abstände nahe 0.50168; bei drei nahe 0.33445.
Die Massendifferenz wird durch eine größere Zahl geteilt. Deshalb rücken die Peaks auf dieser Achse näher zusammen.

Lies die Skala, nicht nur die Form
Zoome in einen klar aufgelösten Cluster und subtrahiere die Positionen benachbarter Peaks. Ein Abstand nahe 0.50 m/z deutet in diesem Modell auf zwei Ladungen hin. Ein Abstand nahe 0.33 deutet auf drei hin.
Das funktioniert nur, wenn du Peaks aus demselben Cluster vergleichst. Überlappende Cluster oder unzureichende Auflösung können die Schätzung irreführend machen.
m/z zurück in die Molekülmasse umrechnen
Angenommen, das Ion ist als [M+2H]2+ bestätigt und sein m/z ist 501.0073. Multipliziere mit zwei und subtrahiere dann die Masse der zwei hinzugefügten Protonen: 2 × 501.0073 − 2 × 1.007276 ≈ 1,000.0000 Da.
Der Abstand hilft, die Ladung abzuschätzen, legt aber für sich genommen nicht den Addukttyp fest. Prüfe die Ionenformel, bevor du diese Berechnung verwendest.

Versuchen Sie, ein Cluster mit drei Ladungen zu lesen
Ein überzeugendes Cluster kann helfen, das Massensignal zu interpretieren. Es misst nicht die Peptidaktivität und legt nicht jede Position in seiner Sequenz fest.
Antwort ansehen
Drei Ladungen, vorausgesetzt, die Peaks gehören zu einem ausreichend aufgelösten Cluster.
Überprüfung von MOTS-c- und SS-31-Plots
Fragen Sie bei MOTS-c- oder SS-31-Spektren, welche Isotopencluster und Ladungszustände die berichtete Molekülmasse stützen. Bewahren Sie das annotierte Spektrum zusammen mit der Berechnung auf.
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MOTS-c (Human)
LL-37