分析方法 · 基礎ガイド
8 Da の重標識なのに 4 の m/z シフト?電荷がその違いを説明します
重標識の質量変化を電荷計算を通して追跡します。
標識は約8 Daを加えますが、スペクトルはわずか4しかシフトしません。これは、一致する二重電荷イオンにまさに期待される通りの結果です。重要なのは、質量スペクトルの軸はしばしば全分子質量ではなくm/zを示すという点です。
なぜ標識ペプチドは重くなるのですか?
安定同位体標識は、選択された原子を指定された位置で指定された重い同位体に置き換えます。特定されていない重金属を結合するという意味ではありません。配列と標識位置を明記する必要があります。
このレッスンでは、意図的に丸めた+8.0000 Daの例を使用します。実際の標識の正確な質量は、その実際の同位体組成から計算しなければなりません。

なぜ8 Daが軸上で4になるのか
それ以外は一致するイオンについて、分子質量の差をその電荷で割ります。電荷が1つならm/zシフトは8、2つなら4、3つなら約2.6667です。
分子は同じ質量を得たままです。変わったのは、軸がその差を表示する方法だけです。

必ずペア同士を比較していることを確認してください
同じ電荷と付加物タイプを持つ軽イオンと重イオンを比較してください。軽い2価ピークと重い3価ピークは、この単純な差の式では比較できません。
同位体パターンとクロマトグラフィー情報は、ペアの確認に役立ちます。そうでなければ、近くにある無関係なピークを重い形態と誤認する可能性があります。
重いピークがあるからといって、自動的に定量標準になるわけではない理由
内部標準は、測定シグナルの比較を助けるために添加する物質です。標識ペプチドをそのように使うには、その同一性と量を把握し、選択した方法での挙動を確認する必要があります。
標識の富化率、残存する未標識物質、試料回収率が影響する場合があります。軽いシグナルと重いシグナルの比を濃度結果にするには、適切に校正された方法が必要です。

別の標識質量を試す
実際の発注では、完全な配列、標識位置、同位体組成、末端基を明記してください。「重いペプチド」だけでは完全な仕様ではありません。
答えを見る
10.0000 ÷ 2 = 5.0000 m/z。
標識MOTS-c配列のリクエスト
プロジェクトで標識MOTS-c配列が必要な場合は、完全な標識仕様をカスタムリクエストとして提出してください。通常のカタログ記録は、標識変異体が利用可能であることを示すものではありません。
