ペプチドの2つのバージョンは、アミノ酸配列が同じでも、分子内で結合が形成されると質量がわずかに異なることがあります。ジスルフィド結合はその一例です。単純な酸化モデルでは、結合が1つ形成されると水素原子が2つ失われます。
結合が形成されるとどうなる？
2つのシステイン側鎖は、硫黄原子を介して結合することがあります。対応する還元型チオールと比較すると、生じたジスルフィドは水素原子が2つ少なくなります。この説明は、他の化学変化を伴わずに特定の結合が形成されることを前提としています。実際の試料には混合物や追加の修飾が含まれることがあります。
計算上の差は約2.016 Daです
NISTは水素-1原子の質量を1.00782503223 Daとしています。2つを除くと、計算上の中性モノアイソトピック質量変化は−2.01565006446 Daになります。教育用の例では、中性モノアイソトピック質量が2000.00000 Daの還元型ペプチドは、そのような結合が1つ形成された後、およそ1997.98435 Daになります。これらは説明用の数値であり、測定されたバッチではありません。
生スペクトルではより小さい間隔が見えることがあります
両方のイオンが電荷+2を持つ場合、対応するm/z間隔はおよそ1.007825です。これは中性質量差の半分です。化学を理解していても、計算した中性質量を直接、未帰属の生イオンピークと比較すると混乱を招くことがあります。
質量は結合の配置を証明するものではない
1つのジスルフィド結合と一致する質量は、複数のシステインが存在する場合に、どのシステイン同士が結合しているかをそれだけでは特定できない。BachemのFAQも、システイン残基と特定のジスルフィド配置の要求を区別している。注文時には、配列中の文字Cだけでなく、意図するシステインのペアリングを提示すること。その配置を裏付ける根拠は何か、また特定の調査に還元比較が必要かどうかを確認すること。
NHDでの次のステップ
まずは ジスルフィドペプチドプロジェクトから始めてください。見積もりのご依頼は、 NHDまで配列または製品名、数量、必要な書類をお送りください。ご注文前に、正確な形態、実現可能性、利用可能な検査、納品条件をご確認ください。
出典
公開参考文献はこのトピックを説明するものであり、NHD バッチの証拠ではありません。研究用材料は実験室での研究、開発、製造用であり、ヒトまたは獣医学用ではありません。
この記事の解釈方法
公開データおよびラベル付き教育用計算であり、NHD バッチ結果ではありません。プロジェクトおよび文書の入手可能性をご確認ください。
研究用途の境界： このウェブサイトで取り上げるカタログ材料は、実験室の研究、開発、製造専用であり、ヒトまたは動物への使用を目的としません。本内容は医療助言ではなく、投与指示を提供しません。
一次記録と権威ある出典
- NIST：水素同位体質量公開参考情報であり、NHD バッチの証拠ではありません。
- Bachem：ペプチド仕様FAQ公開参考情報であり、NHD バッチの証拠ではありません。
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