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ペプチド質量誤差：0.01 Da が異なる ppm 値を示す理由

質量差をppmに変換し、どの質量が比較されたかを確認します。

NHD技術チーム教育用の図3点資料確認：2026-10-11

測定された質量は、期待される質量より 0.01 Da 大きいです。これは近いと言えるでしょうか？それは分子の大きさによります。ppm は、単にダルトンで表すのではなく、期待される質量に対する相対的な差を表します。

Da は差を与え、ppm はその割合を与えます

Da（ダルトン）は分子質量の単位です。0.01 Da の差は絶対差です。ppm は百万分率を意味し、ここでは基準質量に対する質量差の割合を百万倍したものとして表します。

計算式は次のとおりです：ppm 誤差 = （測定質量 − 基準質量）÷ 基準質量 × 1,000,000。

基準値は 1,000.0000 Da で、測定値は 1,000.0100 Da です。引き算すると +0.0100 Da になります。1,000 で割り、1000000を掛けると +10 ppm になります。

プラス記号は測定値がより高いことを意味します。測定値が 999.9900 Da の場合は、代わりに −10 ppm になります。

基準質量 5,000 Da では、+0.01 Da の差は +2 ppm です。同じ絶対差は、より大きな分子の質量に占める割合が小さくなります。

そのため、相対誤差を比較したい場合、「質量が 0.01 Da 異なる」という表現は不完全です。

質量スペクトルの軸はしばしば m/z を示し、これはイオン質量を電荷で割ったものです。それを中性分子質量から直接引かないでください。また、基準が単同位体質量と平均質量のどちらを使っているか確認してください。これらは分子質量を表す異なる方法です。

期待される生成物の形態、修飾、イオン帰属も一致している必要があります。小さな誤差は質量の一致を支持しますが、配列全体や生物活性を証明するものではありません。

計算中は十分な小数点以下の桁数を保持し、最終結果で丸めます。それが許容されるかどうかは、方法とテストされている質問によって異なります。

測定値 2,000.0060 Da、参照値 2,000.0000 Da。誤差はいくらですか？

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+0.0060 ÷ 2,000 × 1,000,000 = +3 ppm。

MOTS-c または SS-31 については、提供された正確な形態の参照質量を使用してください。比較でどの質量タイプとイオンが使用されたかを確認し、ppm 計算が一致する値から始まるようにしてください。