MÉTODOS ANALÍTICOS · GUÍA PRÁCTICA
Error de masa del péptido: por qué 0.01 Da puede significar diferentes valores de ppm
Convierte una diferencia de masa en ppm, luego verifica qué masas se compararon.
La masa medida está 0.01 Da por encima de la masa esperada. ¿Eso es cercano? Depende del tamaño de la molécula. ppm expresa la diferencia con respecto a la masa esperada, no solo en dalton.
Da da la diferencia; ppm da su proporción
Da, o dalton, es una unidad de masa molecular. Una diferencia de 0.01 Da es una diferencia absoluta. ppm significa partes por millón: aquí describe la diferencia de masa como una fracción de la masa de referencia, multiplicada por un millón.
La fórmula es: error en ppm = (masa medida − masa de referencia) ÷ masa de referencia × 1,000,000.
Resuelve un ejemplo con 1,000 Da
La referencia es 1,000.0000 Da y el valor medido es 1,000.0100 Da. La resta da +0.0100 Da. Divide por 1,000 y multiplica por un millón: +10 ppm.
El signo más significa que la medición es mayor. Un valor medido de 999.9900 Da daría en cambio −10 ppm.
Usa la misma diferencia con una molécula más pesada
Con una masa de referencia de 5,000 Da, una diferencia de +0.01 Da es +2 ppm. La misma diferencia absoluta representa una proporción menor de la masa de la molécula más grande.
Por eso “las masas difieren en 0.01 Da” es incompleto cuando quieres comparar errores relativos.
Asegúrate de restar lo mismo con lo mismo
Un eje de espectro de masas suele mostrar m/z, es decir, la masa del ion dividida por la carga. No lo restes directamente de una masa molecular neutra. Comprueba también si la referencia usa masa monoisotópica o masa promedio; son formas distintas de describir la masa molecular.
La forma esperada del producto, las modificaciones y la asignación de iones también deben coincidir. Un error pequeño respalda una coincidencia de masa, pero no prueba toda la secuencia ni la actividad biológica.
Prueba con otro par de valores
Conserva suficientes decimales durante el cálculo y redondea solo el resultado final. Que sea aceptable depende del método y de la pregunta que se está evaluando.
Ver la respuesta
+0.0060 ÷ 2,000 × 1,000,000 = +3 ppm.
Comprobación de un resultado de masa de MOTS-c o SS-31
Para MOTS-c o SS-31, usa la masa de referencia de la forma exacta suministrada. Pregunta qué tipo de masa y qué iones se usaron en la comparación, para que el cálculo de ppm parta de valores que coincidan.
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