MÉTODOS ANALÍTICOS · GUIA PRÁTICO
Erro de massa do peptídeo: por que 0.01 Da pode significar valores de ppm diferentes
Converta uma diferença de massa em ppm e depois verifique quais massas foram comparadas.
A massa medida está 0.01 Da acima da massa esperada. Isso é próximo? Depende do tamanho da molécula. ppm expressa a diferença em relação à massa esperada, em vez de apenas em daltons.
Da fornece a diferença; ppm fornece sua proporção
Da, ou dalton, é uma unidade de massa molecular. Uma diferença de 0.01 Da é uma diferença absoluta. ppm significa partes por milhão: aqui descreve a diferença de massa como uma fração da massa de referência, multiplicada por um milhão.
A fórmula é: erro em ppm = (massa medida − massa de referência) ÷ massa de referência × 1,000,000.
Resolva um exemplo com 1,000 Da
A referência é 1,000.0000 Da e o valor medido é 1,000.0100 Da. A subtração resulta em +0.0100 Da. Divida por 1,000 e multiplique por um milhão: +10 ppm.
O sinal de mais significa que a medição é maior. Um valor medido de 999.9900 Da daria, em vez disso, −10 ppm.
Use a mesma diferença com uma molécula mais pesada
Em uma massa de referência de 5,000 Da, uma diferença de +0.01 Da é +2 ppm. A mesma diferença absoluta ocupa uma fração menor da massa da molécula maior.
É por isso que “as massas diferem em 0.01 Da” é incompleto quando você quer comparar erros relativos.
Certifique-se de subtrair semelhante de semelhante
Um eixo de espectro de massa geralmente mostra m/z, ou seja, massa do íon dividida pela carga. Não subtraia isso diretamente de uma massa molecular neutra. Verifique também se a referência usa massa monoisotópica ou massa média; são formas diferentes de descrever a massa molecular.
A forma esperada do produto, as modificações e a atribuição de íons também precisam corresponder. Um erro pequeno apoia uma correspondência de massa, mas não prova toda a sequência ou a atividade biológica.
Tente outro par de valores
Mantenha casas decimais suficientes durante o cálculo e arredonde o resultado final. Se isso é aceitável depende do método e da questão em teste.
Ver a resposta
+0.0060 ÷ 2,000 × 1,000,000 = +3 ppm.
Verificando um resultado de massa de MOTS-c ou SS-31
Para MOTS-c ou SS-31, use a massa de referência para a forma exata fornecida. Pergunte qual tipo de massa e quais íons foram usados na comparação, para que o cálculo de ppm comece a partir de valores correspondentes.
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